fix(analysis): activate analyst open-questions -> Needs Input flow (ORCH-120)

Activates and completes the previously dead "analyst asks BLOCKING questions ->
01-questions.md -> Needs Input" path. Four coordinated changes, additive, under
kill-switch, self-hosting scope, never-raise; STAGE_TRANSITIONS / QG_CHECKS /
check_* / machine-verdict keys / DB schema are byte-for-byte UNCHANGED (the flow
is a pre-gate engine branch, NOT a Quality Gate; 01-questions.md is a SIGNAL
artifact, NOT a machine-verdict).

- D1 contract + canon: analyst.md documents the 01-questions.md channel (blocking
  questions -> Needs Input, do NOT fabricate deliverables) + resume behaviour; new
  skeleton docs/_templates/01-questions.md; PIPELINE_DOCS.md manifest row + 01-
  prefix note.
- D2 freshness-supersede (DQ-2): pure offline mtime predicate questions_active in
  the new leaf src/analyst_questions.py (a full FRESH package supersedes a stale
  untouched 01-questions.md -> no Needs-Input loop, AC-6).
- D3 priority: questions take priority over "files ready" in
  _handle_analysis_approved_flow (_decide_analysis_outcome + _emit_analysis_*);
  off/out-of-scope runs the ORIGINAL byte-for-byte order (AC-9).
- D4 auto-park: set_task_paused on Needs Input via the ORCH-124 pause axis so the
  repo serial-gate FIFO is not wedged while waiting for a human (AC-4); D5 resume +
  unpark (clear_task_paused) in handle_status_start (analysis branch).

Flags (config.py, safe defaults): analyst_questions_gate_enabled /
analyst_questions_gate_repos (empty -> self-hosting only) /
analyst_needs_input_autopause_enabled.

Tests: test_orch120_analyst_needs_input.py (TC-01 regress + TC-02/03/06/09/10),
test_orch120_serial_gate_needs_input.py (TC-04), test_orch120_resume_unpark.py
(TC-05), test_orch120_questions_artifact_canon.py (TC-08), assert in
test_agent_prompts_canon.py (TC-07). Full suite green (2205 passed).

Refs: ORCH-120

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>

docs/architecture/README.md

@@ -650,7 +650,7 @@ ORCH-027 вводит детерминированный (без LLM) **гейт
 `docs/work-items/ORCH-088/08-data-requirements.md`,
 `docs/work-items/ORCH-124/06-adr/ADR-001-serial-gate-pause-without-blocking.md`.
 
-### Открытые вопросы аналитика → Needs Input (ORCH-120 — design, [adr-0053](adr/adr-0053-analyst-open-questions-needs-input-flow.md))
+### Открытые вопросы аналитика → Needs Input (ORCH-120 — реализовано, [adr-0053](adr/adr-0053-analyst-open-questions-needs-input-flow.md))
 При неоднозначном бизнес-запросе у аналитика не было рабочего канала уточнения — он **фабриковал**
 требования, чтобы сдать обязательные 4 файла. Механизм «вопросы → Needs Input» в
 `_handle_analysis_approved_flow` (`src/stage_engine.py`) существовал, но был **мёртв** (контракт не в
@@ -663,7 +663,10 @@ self-hosting, never-raise; `STAGE_TRANSITIONS`/`QG_CHECKS`/`check_*`/machine-ver
   `01-questions.md`, НЕ фабриковать deliverables»; `01-questions.md` стандартизирован как
   `when-applicable` сигнальный артефакт (скелет `docs/_templates/` + строка `PIPELINE_DOCS.md`).
 - **Приоритет «вопросы активны» > «файлы готовы»** в `_handle_analysis_approved_flow` (DQ-3) →
-  блокирующие вопросы достигают Needs Input даже при частичных/сфабрикованных deliverables.
+  блокирующие вопросы достигают Needs Input даже при частичных/сфабрикованных deliverables. Чистая
+  логика решения — leaf `src/analyst_questions.py` (`questions_gate_applies`/`autopause_applies`/
+  `questions_active`, never-raise); side-effects (`set_issue_needs_input`/коммент/Telegram/park) —
+  в `stage_engine` (`_decide_analysis_outcome`/`_emit_analysis_*`).
 - **Авто-park (DQ-1)** через ось «пауза» ORCH-124 (`db.set_task_paused` при Needs Input) → задача
   исключается из «активного» предиката serial-gate, FIFO репо не клинит, пока ждём человека;
   **resume + unpark** в `handle_status_start` (analysis-ветка, `clear_task_paused`).